Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms