Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMG1Q96Q15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG1Q96Q15 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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