Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab4bQ91ZR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rab4bQ91ZR1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab4bQ91ZR1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms