Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prpf6Q91YR7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prpf6Q91YR7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf6Q91YR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms