Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
TRIM41Q8WV44 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
TRIM41Q8WV44 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
TRIM41Q8WV44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
TRIM41Q8WV44 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms