Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup58Q8R332 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup58Q8R332 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nup58Q8R332 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup58Q8R332 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms