Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pggt1bQ8BUY9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pggt1bQ8BUY9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pggt1bQ8BUY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms