Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ1

Hpcal4, Hippocalcin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal4Q8BGZ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hpcal4Q8BGZ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hpcal4Q8BGZ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hpcal4Q8BGZ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms