Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp3Q7TST5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lamp3Q7TST5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lamp3Q7TST5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms