Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tcaf3Q6QR59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcaf3Q6QR59 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcaf3Q6QR59 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms