Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5431Q5NCB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5431Q5NCB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5431Q5NCB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5431Q5NCB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5431Q5NCB3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5431Q5NCB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms