Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATRQ13535 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATRQ13535 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATRQ13535 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATRQ13535 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATRQ13535 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATRQ13535 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATRQ13535 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATRQ13535 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATRQ13535 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATRQ13535 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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