Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pou6f1Q07916 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou6f1Q07916 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pou6f1Q07916 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou6f1Q07916 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms