Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Msx2Q03358 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Msx2Q03358 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Msx2Q03358 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms