Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjb2Q00977 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjb2Q00977 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjb2Q00977 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjb2Q00977 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms