Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ufd1P70362 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufd1P70362 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufd1P70362 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms