Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sssca1P56873 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sssca1P56873 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sssca1P56873 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms