Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.52□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YIM2YMR151W 438 nt5.52□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MTC5YDR128W 3447 nt5.52□□□□□ -1.53
PUS4P48567 FLC3YGL139W 2409 nt5.52□□□□□ -1.53
PUS4P48567 STL1YDR536W 1710 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 FMP40YPL222W 2067 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MRPL1YDR116C 858 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 PMP3YDR276C 168 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MRPS28YDR337W 861 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 HSP31YDR533C 714 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CAF16YFL028C 870 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 AGX1YFL030W 1158 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SMX3YPR182W 261 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 TIP20YGL145W 2106 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 RNR3YIL066C 2610 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CLB2YPR119W 1476 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 AAP1YHR047C 2571 nt5.51□□□□□ -1.53
PUS4P48567 UBP9YER098W 2265 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 TUL1YKL034W 2277 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 RPL12AYEL054C 498 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 FMO1YHR176W 1299 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 REC107YJR021C 945 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YPR015CYPR015C 744 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YBR113WYBR113W 483 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 ALT1YLR089C 1779 nt5.5□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YJR124CYJR124C 1347 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YHK8YHR048W 1545 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 ZWF1YNL241C 1518 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 GPD1YDL022W 1176 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 PRS2YER099C 957 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 RPP1YHR062C 882 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 DMA1YHR115C 1251 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 GEP5YLR091W 882 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 LDB7YBL006C 543 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CAR1YPL111W 1002 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 RAD57YDR004W 1383 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 GAS2YLR343W 1668 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 ERG7YHR072W 2196 nt5.49□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MTF2YDL044C 1323 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CUS1YMR240C 1311 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YME1YPR024W 2244 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CCC2YDR270W 3015 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 COX10YPL172C 1389 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 GRX6YDL010W 696 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 LUC7YDL087C 786 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 VPS61YDR136C 573 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 CHO1YER026C 831 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 RPN11YFR004W 921 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 VAM7YGL212W 951 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MND2YIR025W 1107 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 NTR2YKR022C 969 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YSA1YBR111C 696 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MRC1YCL061C 3291 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 TGL1YKL140W 1647 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 ABD1YBR236C 1311 nt5.48□□□□□ -1.53
PUS4P48567 UTP7YER082C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SIS2YKR072C 1689 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YHL012WYHL012W 1482 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 ARB1YER036C 1833 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MAF1YDR005C 1188 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 URA3YEL021W 804 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 MHO1YJR008W 1017 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 SEC13YLR208W 894 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YMR279CYMR279C 1623 nt5.47□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YDL109CYDL109C 1944 nt5.46□□□□□ -1.53
PUS4P48567 PPM2YOL141W 2088 nt5.46□□□□□ -1.53
PUS4P48567 YHR177WYHR177W 1362 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 SPG1YGR236C 288 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 YIL028WYIL028W 399 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 YJR056CYJR056C 711 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 FBA1YKL060C 1080 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 YKR104WYKR104W 921 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 PSR2YLR019W 1194 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 RPS0BYLR048W 759 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 YLR326WYLR326W 723 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 YLR374CYLR374C 390 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 MRPS18YNL306W 654 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 SCT1YBL011W 2280 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 MIP1YOR330C 3765 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 VMA13YPR036W 1437 nt5.46□□□□□ -1.54
PUS4P48567 PPR1YLR014C 2715 nt5.46□□□□□ -1.54
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