Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prox1P48437 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prox1P48437 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prox1P48437 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms