Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vav1P27870 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav1P27870 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vav1P27870 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav1P27870 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav1P27870 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vav1P27870 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vav1P27870 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms