Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZfaP23607 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZfaP23607 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZfaP23607 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZfaP23607 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZfaP23607 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZfaP23607 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZfaP23607 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms