Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl1P10146 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccl1P10146 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccl1P10146 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms