Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pax1P09084 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pax1P09084 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pax1P09084 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax1P09084 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pax1P09084 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax1P09084 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax1P09084 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms