Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap1O55125 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap1O55125 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nipsnap1O55125 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms