Protein–RNA interactions for Protein: O43149

ZZEF1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZZEF1O43149 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZZEF1O43149 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZZEF1O43149 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZZEF1O43149 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZZEF1O43149 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms