Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CEP290O15078 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CEP290O15078 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CEP290O15078 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP290O15078 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CEP290O15078 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CEP290O15078 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CEP290O15078 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP290O15078 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CEP290O15078 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP290O15078 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP290O15078 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP290O15078 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP290O15078 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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