Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms