Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem200bD3Z0P8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms