Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cped1B2RX70 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cped1B2RX70 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cped1B2RX70 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms