Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm438B1ASB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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