Protein–RNA interactions for Protein: S4R2D1

Gm5493, Predicted gene 5493, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5493S4R2D1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5493S4R2D1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5493S4R2D1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5493S4R2D1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5493S4R2D1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5493S4R2D1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5493S4R2D1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5493S4R2D1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5493S4R2D1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5493S4R2D1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5493S4R2D1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5493S4R2D1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5493S4R2D1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5493S4R2D1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5493S4R2D1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5493S4R2D1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5493S4R2D1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5493S4R2D1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5493S4R2D1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5493S4R2D1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5493S4R2D1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5493S4R2D1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5493S4R2D1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5493S4R2D1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm5493S4R2D1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5493S4R2D1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5493S4R2D1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5493S4R2D1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5493S4R2D1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5493S4R2D1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5493S4R2D1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm5493S4R2D1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5493S4R2D1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5493S4R2D1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5493S4R2D1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5493S4R2D1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm5493S4R2D1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm5493S4R2D1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm5493S4R2D1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm5493S4R2D1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm5493S4R2D1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5493S4R2D1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5493S4R2D1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5493S4R2D1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5493S4R2D1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5493S4R2D1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5493S4R2D1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5493S4R2D1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms