Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Top3bQ9Z321 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top3bQ9Z321 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top3bQ9Z321 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Top3bQ9Z321 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Top3bQ9Z321 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Top3bQ9Z321 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top3bQ9Z321 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Top3bQ9Z321 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Top3bQ9Z321 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Top3bQ9Z321 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top3bQ9Z321 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Top3bQ9Z321 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top3bQ9Z321 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top3bQ9Z321 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Top3bQ9Z321 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top3bQ9Z321 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Top3bQ9Z321 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Top3bQ9Z321 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Top3bQ9Z321 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top3bQ9Z321 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top3bQ9Z321 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Top3bQ9Z321 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Top3bQ9Z321 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top3bQ9Z321 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Top3bQ9Z321 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top3bQ9Z321 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Top3bQ9Z321 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top3bQ9Z321 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Top3bQ9Z321 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top3bQ9Z321 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top3bQ9Z321 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Top3bQ9Z321 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Top3bQ9Z321 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Top3bQ9Z321 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top3bQ9Z321 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top3bQ9Z321 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Top3bQ9Z321 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top3bQ9Z321 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top3bQ9Z321 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top3bQ9Z321 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top3bQ9Z321 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top3bQ9Z321 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top3bQ9Z321 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Top3bQ9Z321 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Top3bQ9Z321 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top3bQ9Z321 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top3bQ9Z321 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top3bQ9Z321 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Top3bQ9Z321 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Top3bQ9Z321 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Top3bQ9Z321 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Top3bQ9Z321 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top3bQ9Z321 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top3bQ9Z321 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Top3bQ9Z321 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top3bQ9Z321 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Top3bQ9Z321 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top3bQ9Z321 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top3bQ9Z321 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top3bQ9Z321 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top3bQ9Z321 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Top3bQ9Z321 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms