Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CcniQ9Z2V9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcniQ9Z2V9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CcniQ9Z2V9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CcniQ9Z2V9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CcniQ9Z2V9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcniQ9Z2V9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CcniQ9Z2V9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CcniQ9Z2V9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CcniQ9Z2V9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CcniQ9Z2V9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CcniQ9Z2V9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CcniQ9Z2V9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CcniQ9Z2V9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CcniQ9Z2V9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CcniQ9Z2V9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CcniQ9Z2V9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CcniQ9Z2V9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CcniQ9Z2V9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcniQ9Z2V9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CcniQ9Z2V9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CcniQ9Z2V9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CcniQ9Z2V9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CcniQ9Z2V9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcniQ9Z2V9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CcniQ9Z2V9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CcniQ9Z2V9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CcniQ9Z2V9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CcniQ9Z2V9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CcniQ9Z2V9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CcniQ9Z2V9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcniQ9Z2V9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CcniQ9Z2V9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CcniQ9Z2V9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CcniQ9Z2V9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CcniQ9Z2V9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CcniQ9Z2V9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CcniQ9Z2V9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CcniQ9Z2V9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CcniQ9Z2V9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CcniQ9Z2V9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CcniQ9Z2V9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CcniQ9Z2V9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CcniQ9Z2V9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CcniQ9Z2V9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcniQ9Z2V9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcniQ9Z2V9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcniQ9Z2V9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcniQ9Z2V9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcniQ9Z2V9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcniQ9Z2V9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcniQ9Z2V9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CcniQ9Z2V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcniQ9Z2V9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CcniQ9Z2V9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcniQ9Z2V9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcniQ9Z2V9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcniQ9Z2V9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CcniQ9Z2V9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms