Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U4

Elf4, ETS-related transcription factor Elf-4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf4Q9Z2U4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Elf4Q9Z2U4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Elf4Q9Z2U4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Elf4Q9Z2U4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Elf4Q9Z2U4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Elf4Q9Z2U4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Elf4Q9Z2U4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Elf4Q9Z2U4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Elf4Q9Z2U4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Elf4Q9Z2U4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Elf4Q9Z2U4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Elf4Q9Z2U4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Elf4Q9Z2U4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Elf4Q9Z2U4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Elf4Q9Z2U4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Elf4Q9Z2U4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Elf4Q9Z2U4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elf4Q9Z2U4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elf4Q9Z2U4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elf4Q9Z2U4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Elf4Q9Z2U4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Elf4Q9Z2U4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elf4Q9Z2U4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Elf4Q9Z2U4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Elf4Q9Z2U4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Elf4Q9Z2U4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Elf4Q9Z2U4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Elf4Q9Z2U4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Elf4Q9Z2U4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Elf4Q9Z2U4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Elf4Q9Z2U4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Elf4Q9Z2U4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Elf4Q9Z2U4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Elf4Q9Z2U4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Elf4Q9Z2U4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Elf4Q9Z2U4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Elf4Q9Z2U4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Elf4Q9Z2U4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Elf4Q9Z2U4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Elf4Q9Z2U4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Elf4Q9Z2U4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Elf4Q9Z2U4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Elf4Q9Z2U4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Elf4Q9Z2U4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Elf4Q9Z2U4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Elf4Q9Z2U4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Elf4Q9Z2U4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Elf4Q9Z2U4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Elf4Q9Z2U4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Elf4Q9Z2U4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Elf4Q9Z2U4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Elf4Q9Z2U4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Elf4Q9Z2U4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Elf4Q9Z2U4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Elf4Q9Z2U4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Elf4Q9Z2U4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Elf4Q9Z2U4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Elf4Q9Z2U4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Elf4Q9Z2U4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Elf4Q9Z2U4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Elf4Q9Z2U4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Elf4Q9Z2U4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Elf4Q9Z2U4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Elf4Q9Z2U4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Elf4Q9Z2U4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Elf4Q9Z2U4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Elf4Q9Z2U4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Elf4Q9Z2U4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Elf4Q9Z2U4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Elf4Q9Z2U4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Elf4Q9Z2U4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Elf4Q9Z2U4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.9 ms