Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Gdf11Q9Z1W4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gdf11Q9Z1W4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Gdf11Q9Z1W4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Gdf11Q9Z1W4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Gdf11Q9Z1W4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Gdf11Q9Z1W4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Gdf11Q9Z1W4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Gdf11Q9Z1W4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Gdf11Q9Z1W4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Gdf11Q9Z1W4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Gdf11Q9Z1W4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Gdf11Q9Z1W4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Gdf11Q9Z1W4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Gdf11Q9Z1W4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Gdf11Q9Z1W4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gdf11Q9Z1W4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gdf11Q9Z1W4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gdf11Q9Z1W4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gdf11Q9Z1W4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gdf11Q9Z1W4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Gdf11Q9Z1W4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gdf11Q9Z1W4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gdf11Q9Z1W4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gdf11Q9Z1W4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Gdf11Q9Z1W4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Gdf11Q9Z1W4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gdf11Q9Z1W4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Gdf11Q9Z1W4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gdf11Q9Z1W4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gdf11Q9Z1W4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Gdf11Q9Z1W4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Gdf11Q9Z1W4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Gdf11Q9Z1W4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Gdf11Q9Z1W4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Gdf11Q9Z1W4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Gdf11Q9Z1W4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Gdf11Q9Z1W4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gdf11Q9Z1W4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Gdf11Q9Z1W4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gdf11Q9Z1W4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gdf11Q9Z1W4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Gdf11Q9Z1W4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Gdf11Q9Z1W4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gdf11Q9Z1W4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Gdf11Q9Z1W4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Gdf11Q9Z1W4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Gdf11Q9Z1W4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Gdf11Q9Z1W4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gdf11Q9Z1W4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Gdf11Q9Z1W4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Gdf11Q9Z1W4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gdf11Q9Z1W4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Gdf11Q9Z1W4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Gdf11Q9Z1W4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Gdf11Q9Z1W4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Gdf11Q9Z1W4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gdf11Q9Z1W4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gdf11Q9Z1W4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gdf11Q9Z1W4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gdf11Q9Z1W4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gdf11Q9Z1W4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gdf11Q9Z1W4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gdf11Q9Z1W4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gdf11Q9Z1W4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gdf11Q9Z1W4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gdf11Q9Z1W4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gdf11Q9Z1W4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gdf11Q9Z1W4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gdf11Q9Z1W4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Gdf11Q9Z1W4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gdf11Q9Z1W4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms