Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Creb3l1Q9Z125 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Creb3l1Q9Z125 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Creb3l1Q9Z125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Creb3l1Q9Z125 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Creb3l1Q9Z125 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Creb3l1Q9Z125 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Creb3l1Q9Z125 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Creb3l1Q9Z125 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Creb3l1Q9Z125 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Creb3l1Q9Z125 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l1Q9Z125 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Creb3l1Q9Z125 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Creb3l1Q9Z125 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Creb3l1Q9Z125 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Creb3l1Q9Z125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Creb3l1Q9Z125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Creb3l1Q9Z125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Creb3l1Q9Z125 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Creb3l1Q9Z125 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l1Q9Z125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l1Q9Z125 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Creb3l1Q9Z125 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l1Q9Z125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l1Q9Z125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l1Q9Z125 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l1Q9Z125 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l1Q9Z125 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Creb3l1Q9Z125 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Creb3l1Q9Z125 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Creb3l1Q9Z125 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Creb3l1Q9Z125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Creb3l1Q9Z125 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Creb3l1Q9Z125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Creb3l1Q9Z125 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Creb3l1Q9Z125 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Creb3l1Q9Z125 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Creb3l1Q9Z125 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Creb3l1Q9Z125 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Creb3l1Q9Z125 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Creb3l1Q9Z125 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Creb3l1Q9Z125 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Creb3l1Q9Z125 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Creb3l1Q9Z125 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Creb3l1Q9Z125 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms