Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clcn5Q9WVD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Clcn5Q9WVD4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clcn5Q9WVD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clcn5Q9WVD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clcn5Q9WVD4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clcn5Q9WVD4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clcn5Q9WVD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clcn5Q9WVD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clcn5Q9WVD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clcn5Q9WVD4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Clcn5Q9WVD4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clcn5Q9WVD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Clcn5Q9WVD4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clcn5Q9WVD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Clcn5Q9WVD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Clcn5Q9WVD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Clcn5Q9WVD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Clcn5Q9WVD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Clcn5Q9WVD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Clcn5Q9WVD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Clcn5Q9WVD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Clcn5Q9WVD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Clcn5Q9WVD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Clcn5Q9WVD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Clcn5Q9WVD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Clcn5Q9WVD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Clcn5Q9WVD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clcn5Q9WVD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Clcn5Q9WVD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clcn5Q9WVD4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Clcn5Q9WVD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Clcn5Q9WVD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Clcn5Q9WVD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Clcn5Q9WVD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Clcn5Q9WVD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Clcn5Q9WVD4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Clcn5Q9WVD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clcn5Q9WVD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clcn5Q9WVD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clcn5Q9WVD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clcn5Q9WVD4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn5Q9WVD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn5Q9WVD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn5Q9WVD4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clcn5Q9WVD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clcn5Q9WVD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clcn5Q9WVD4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clcn5Q9WVD4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Clcn5Q9WVD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clcn5Q9WVD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Clcn5Q9WVD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clcn5Q9WVD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clcn5Q9WVD4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clcn5Q9WVD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clcn5Q9WVD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Clcn5Q9WVD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clcn5Q9WVD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Clcn5Q9WVD4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Clcn5Q9WVD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clcn5Q9WVD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Clcn5Q9WVD4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Clcn5Q9WVD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms