Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Slit3Q9WVB4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Slit3Q9WVB4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Slit3Q9WVB4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Slit3Q9WVB4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Slit3Q9WVB4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Slit3Q9WVB4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Slit3Q9WVB4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Slit3Q9WVB4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Slit3Q9WVB4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Slit3Q9WVB4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Slit3Q9WVB4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Slit3Q9WVB4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Slit3Q9WVB4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Slit3Q9WVB4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Slit3Q9WVB4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
Slit3Q9WVB4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Slit3Q9WVB4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
Slit3Q9WVB4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Slit3Q9WVB4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Slit3Q9WVB4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Slit3Q9WVB4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
Slit3Q9WVB4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Slit3Q9WVB4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Slit3Q9WVB4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Slit3Q9WVB4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Slit3Q9WVB4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Slit3Q9WVB4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Slit3Q9WVB4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Slit3Q9WVB4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Slit3Q9WVB4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Slit3Q9WVB4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Slit3Q9WVB4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Slit3Q9WVB4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Slit3Q9WVB4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Slit3Q9WVB4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Slit3Q9WVB4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Slit3Q9WVB4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Slit3Q9WVB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Slit3Q9WVB4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Slit3Q9WVB4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Slit3Q9WVB4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Slit3Q9WVB4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Slit3Q9WVB4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Slit3Q9WVB4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Slit3Q9WVB4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Slit3Q9WVB4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Slit3Q9WVB4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Slit3Q9WVB4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Slit3Q9WVB4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Slit3Q9WVB4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Slit3Q9WVB4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Slit3Q9WVB4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Slit3Q9WVB4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Slit3Q9WVB4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Slit3Q9WVB4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Slit3Q9WVB4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Slit3Q9WVB4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Slit3Q9WVB4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Slit3Q9WVB4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Slit3Q9WVB4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Slit3Q9WVB4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Slit3Q9WVB4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Slit3Q9WVB4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Slit3Q9WVB4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Slit3Q9WVB4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Slit3Q9WVB4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Slit3Q9WVB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Slit3Q9WVB4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Slit3Q9WVB4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Slit3Q9WVB4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Slit3Q9WVB4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Slit3Q9WVB4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Slit3Q9WVB4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Slit3Q9WVB4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Slit3Q9WVB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Slit3Q9WVB4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Slit3Q9WVB4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms