Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Apobec2Q9WV35 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Apobec2Q9WV35 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Apobec2Q9WV35 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Apobec2Q9WV35 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Apobec2Q9WV35 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Apobec2Q9WV35 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Apobec2Q9WV35 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Apobec2Q9WV35 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Apobec2Q9WV35 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Apobec2Q9WV35 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Apobec2Q9WV35 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Apobec2Q9WV35 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Apobec2Q9WV35 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Apobec2Q9WV35 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Apobec2Q9WV35 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Apobec2Q9WV35 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Apobec2Q9WV35 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Apobec2Q9WV35 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Apobec2Q9WV35 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Apobec2Q9WV35 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Apobec2Q9WV35 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Apobec2Q9WV35 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Apobec2Q9WV35 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Apobec2Q9WV35 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Apobec2Q9WV35 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Apobec2Q9WV35 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Apobec2Q9WV35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Apobec2Q9WV35 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Apobec2Q9WV35 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Apobec2Q9WV35 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Apobec2Q9WV35 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Apobec2Q9WV35 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Apobec2Q9WV35 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Apobec2Q9WV35 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Apobec2Q9WV35 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Apobec2Q9WV35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Apobec2Q9WV35 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Apobec2Q9WV35 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Apobec2Q9WV35 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Apobec2Q9WV35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Apobec2Q9WV35 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Apobec2Q9WV35 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Apobec2Q9WV35 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Apobec2Q9WV35 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Apobec2Q9WV35 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Apobec2Q9WV35 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Apobec2Q9WV35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Apobec2Q9WV35 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Apobec2Q9WV35 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Apobec2Q9WV35 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Apobec2Q9WV35 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Apobec2Q9WV35 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Apobec2Q9WV35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Apobec2Q9WV35 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Apobec2Q9WV35 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Apobec2Q9WV35 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Apobec2Q9WV35 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Apobec2Q9WV35 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Apobec2Q9WV35 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Apobec2Q9WV35 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Apobec2Q9WV35 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Apobec2Q9WV35 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms