Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MthfrQ9WU20 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfrQ9WU20 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfrQ9WU20 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfrQ9WU20 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfrQ9WU20 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfrQ9WU20 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MthfrQ9WU20 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MthfrQ9WU20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MthfrQ9WU20 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MthfrQ9WU20 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MthfrQ9WU20 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MthfrQ9WU20 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MthfrQ9WU20 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MthfrQ9WU20 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MthfrQ9WU20 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MthfrQ9WU20 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MthfrQ9WU20 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MthfrQ9WU20 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MthfrQ9WU20 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MthfrQ9WU20 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MthfrQ9WU20 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MthfrQ9WU20 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MthfrQ9WU20 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MthfrQ9WU20 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MthfrQ9WU20 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MthfrQ9WU20 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MthfrQ9WU20 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MthfrQ9WU20 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MthfrQ9WU20 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MthfrQ9WU20 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MthfrQ9WU20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MthfrQ9WU20 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MthfrQ9WU20 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MthfrQ9WU20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MthfrQ9WU20 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms