Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sept6Q9R1T4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sept6Q9R1T4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sept6Q9R1T4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sept6Q9R1T4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sept6Q9R1T4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sept6Q9R1T4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sept6Q9R1T4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sept6Q9R1T4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sept6Q9R1T4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sept6Q9R1T4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sept6Q9R1T4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sept6Q9R1T4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sept6Q9R1T4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sept6Q9R1T4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sept6Q9R1T4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sept6Q9R1T4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sept6Q9R1T4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sept6Q9R1T4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sept6Q9R1T4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sept6Q9R1T4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Sept6Q9R1T4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sept6Q9R1T4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sept6Q9R1T4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sept6Q9R1T4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sept6Q9R1T4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sept6Q9R1T4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sept6Q9R1T4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sept6Q9R1T4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sept6Q9R1T4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sept6Q9R1T4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sept6Q9R1T4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sept6Q9R1T4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sept6Q9R1T4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sept6Q9R1T4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sept6Q9R1T4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept6Q9R1T4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sept6Q9R1T4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sept6Q9R1T4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sept6Q9R1T4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sept6Q9R1T4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sept6Q9R1T4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sept6Q9R1T4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sept6Q9R1T4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sept6Q9R1T4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sept6Q9R1T4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sept6Q9R1T4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sept6Q9R1T4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sept6Q9R1T4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sept6Q9R1T4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sept6Q9R1T4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sept6Q9R1T4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sept6Q9R1T4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sept6Q9R1T4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sept6Q9R1T4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sept6Q9R1T4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sept6Q9R1T4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sept6Q9R1T4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sept6Q9R1T4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sept6Q9R1T4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept6Q9R1T4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept6Q9R1T4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms