Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmb3Q9R1P1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb3Q9R1P1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmb3Q9R1P1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb3Q9R1P1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb3Q9R1P1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmb3Q9R1P1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb3Q9R1P1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb3Q9R1P1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb3Q9R1P1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb3Q9R1P1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb3Q9R1P1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb3Q9R1P1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb3Q9R1P1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb3Q9R1P1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb3Q9R1P1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psmb3Q9R1P1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb3Q9R1P1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb3Q9R1P1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb3Q9R1P1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb3Q9R1P1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb3Q9R1P1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb3Q9R1P1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb3Q9R1P1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb3Q9R1P1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmb3Q9R1P1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmb3Q9R1P1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb3Q9R1P1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmb3Q9R1P1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb3Q9R1P1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb3Q9R1P1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmb3Q9R1P1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb3Q9R1P1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb3Q9R1P1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmb3Q9R1P1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmb3Q9R1P1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms