Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ChmQ9QXG2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ChmQ9QXG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ChmQ9QXG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ChmQ9QXG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ChmQ9QXG2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ChmQ9QXG2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ChmQ9QXG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChmQ9QXG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ChmQ9QXG2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ChmQ9QXG2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ChmQ9QXG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ChmQ9QXG2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ChmQ9QXG2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ChmQ9QXG2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ChmQ9QXG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ChmQ9QXG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ChmQ9QXG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ChmQ9QXG2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ChmQ9QXG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ChmQ9QXG2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ChmQ9QXG2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ChmQ9QXG2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ChmQ9QXG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ChmQ9QXG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ChmQ9QXG2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChmQ9QXG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ChmQ9QXG2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ChmQ9QXG2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ChmQ9QXG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ChmQ9QXG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ChmQ9QXG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ChmQ9QXG2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChmQ9QXG2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ChmQ9QXG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ChmQ9QXG2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ChmQ9QXG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ChmQ9QXG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ChmQ9QXG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChmQ9QXG2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChmQ9QXG2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ChmQ9QXG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ChmQ9QXG2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ChmQ9QXG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ChmQ9QXG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ChmQ9QXG2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms