Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Dpf1Q9QX66 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Dpf1Q9QX66 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Dpf1Q9QX66 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35,46■■■■□ 3,27
Dpf1Q9QX66 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Dpf1Q9QX66 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Dpf1Q9QX66 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35,43■■■■□ 3,26
Dpf1Q9QX66 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Dpf1Q9QX66 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,38■■■■□ 3,25
Dpf1Q9QX66 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Dpf1Q9QX66 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
Dpf1Q9QX66 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Dpf1Q9QX66 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,25■■■■□ 3,23
Dpf1Q9QX66 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Dpf1Q9QX66 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,18■■■■□ 3,22
Dpf1Q9QX66 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Dpf1Q9QX66 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Dpf1Q9QX66 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Dpf1Q9QX66 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Dpf1Q9QX66 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Dpf1Q9QX66 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,94■■■■□ 3,18
Dpf1Q9QX66 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,88■■■■□ 3,17
Dpf1Q9QX66 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Dpf1Q9QX66 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,86■■■■□ 3,17
Dpf1Q9QX66 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Dpf1Q9QX66 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Dpf1Q9QX66 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,77■■■■□ 3,16
Dpf1Q9QX66 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Dpf1Q9QX66 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Dpf1Q9QX66 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Dpf1Q9QX66 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,71■■■■□ 3,15
Dpf1Q9QX66 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,69■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,68■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,67■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,65■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Dpf1Q9QX66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,63■■■■□ 3,13
Dpf1Q9QX66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Dpf1Q9QX66 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Dpf1Q9QX66 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,6■■■■□ 3,13
Dpf1Q9QX66 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Dpf1Q9QX66 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Dpf1Q9QX66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,54■■■■□ 3,12
Dpf1Q9QX66 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Dpf1Q9QX66 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
Dpf1Q9QX66 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Dpf1Q9QX66 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Dpf1Q9QX66 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,4■■■■□ 3,1
Dpf1Q9QX66 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,37■■■■□ 3,09
Dpf1Q9QX66 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Dpf1Q9QX66 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Dpf1Q9QX66 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Dpf1Q9QX66 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,07
Dpf1Q9QX66 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Dpf1Q9QX66 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,21■■■■□ 3,07
Dpf1Q9QX66 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Dpf1Q9QX66 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Dpf1Q9QX66 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Dpf1Q9QX66 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Dpf1Q9QX66 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Dpf1Q9QX66 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Dpf1Q9QX66 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Dpf1Q9QX66 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Dpf1Q9QX66 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Dpf1Q9QX66 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Dpf1Q9QX66 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Dpf1Q9QX66 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Dpf1Q9QX66 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34,01■■■■□ 3,04
Dpf1Q9QX66 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Dpf1Q9QX66 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Dpf1Q9QX66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Dpf1Q9QX66 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Dpf1Q9QX66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33,94■■■■□ 3,02
Dpf1Q9QX66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Dpf1Q9QX66 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Dpf1Q9QX66 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,84■■■■□ 3,01
Dpf1Q9QX66 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Dpf1Q9QX66 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Dpf1Q9QX66 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Dpf1Q9QX66 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,77■■■■□ 3
Dpf1Q9QX66 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Dpf1Q9QX66 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,72■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Dpf1Q9QX66 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Dpf1Q9QX66 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Dpf1Q9QX66 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Dpf1Q9QX66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Dpf1Q9QX66 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Dpf1Q9QX66 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Dpf1Q9QX66 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,58■■■□□ 2,97
Dpf1Q9QX66 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Dpf1Q9QX66 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Dpf1Q9QX66 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,56■■■□□ 2,96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49,2 ms