Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnaja4Q9JMC3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnaja4Q9JMC3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnaja4Q9JMC3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnaja4Q9JMC3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaja4Q9JMC3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnaja4Q9JMC3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnaja4Q9JMC3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaja4Q9JMC3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaja4Q9JMC3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dnaja4Q9JMC3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dnaja4Q9JMC3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaja4Q9JMC3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnaja4Q9JMC3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnaja4Q9JMC3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnaja4Q9JMC3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnaja4Q9JMC3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnaja4Q9JMC3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnaja4Q9JMC3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnaja4Q9JMC3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnaja4Q9JMC3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnaja4Q9JMC3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnaja4Q9JMC3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnaja4Q9JMC3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnaja4Q9JMC3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnaja4Q9JMC3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dnaja4Q9JMC3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dnaja4Q9JMC3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaja4Q9JMC3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dnaja4Q9JMC3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dnaja4Q9JMC3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dnaja4Q9JMC3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnaja4Q9JMC3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnaja4Q9JMC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnaja4Q9JMC3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaja4Q9JMC3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnaja4Q9JMC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dnaja4Q9JMC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnaja4Q9JMC3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnaja4Q9JMC3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnaja4Q9JMC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnaja4Q9JMC3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnaja4Q9JMC3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaja4Q9JMC3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnaja4Q9JMC3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnaja4Q9JMC3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnaja4Q9JMC3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnaja4Q9JMC3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnaja4Q9JMC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnaja4Q9JMC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnaja4Q9JMC3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dnaja4Q9JMC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms