Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Higd1aQ9JLR9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Higd1aQ9JLR9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Higd1aQ9JLR9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Higd1aQ9JLR9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Higd1aQ9JLR9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Higd1aQ9JLR9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Higd1aQ9JLR9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Higd1aQ9JLR9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Higd1aQ9JLR9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Higd1aQ9JLR9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Higd1aQ9JLR9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Higd1aQ9JLR9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Higd1aQ9JLR9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Higd1aQ9JLR9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Higd1aQ9JLR9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Higd1aQ9JLR9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Higd1aQ9JLR9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1aQ9JLR9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Higd1aQ9JLR9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Higd1aQ9JLR9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Higd1aQ9JLR9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Higd1aQ9JLR9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Higd1aQ9JLR9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Higd1aQ9JLR9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Higd1aQ9JLR9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Higd1aQ9JLR9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Higd1aQ9JLR9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Higd1aQ9JLR9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Higd1aQ9JLR9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Higd1aQ9JLR9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Higd1aQ9JLR9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1aQ9JLR9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Higd1aQ9JLR9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Higd1aQ9JLR9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Higd1aQ9JLR9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Higd1aQ9JLR9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Higd1aQ9JLR9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Higd1aQ9JLR9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Higd1aQ9JLR9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms