Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Crim1Q9JLL0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Crim1Q9JLL0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Crim1Q9JLL0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Crim1Q9JLL0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Crim1Q9JLL0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Crim1Q9JLL0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Crim1Q9JLL0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Crim1Q9JLL0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Crim1Q9JLL0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,46
Crim1Q9JLL0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Crim1Q9JLL0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Crim1Q9JLL0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,13■■□□□ 1,45
Crim1Q9JLL0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Crim1Q9JLL0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Crim1Q9JLL0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Crim1Q9JLL0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Crim1Q9JLL0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
Crim1Q9JLL0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Crim1Q9JLL0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Crim1Q9JLL0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Crim1Q9JLL0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Crim1Q9JLL0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Crim1Q9JLL0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Crim1Q9JLL0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Crim1Q9JLL0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Crim1Q9JLL0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Crim1Q9JLL0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Crim1Q9JLL0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Crim1Q9JLL0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Crim1Q9JLL0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Crim1Q9JLL0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,74■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Crim1Q9JLL0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Crim1Q9JLL0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Crim1Q9JLL0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Crim1Q9JLL0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Crim1Q9JLL0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Crim1Q9JLL0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Crim1Q9JLL0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Crim1Q9JLL0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Crim1Q9JLL0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Crim1Q9JLL0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,33■■□□□ 1,33
Crim1Q9JLL0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Crim1Q9JLL0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Crim1Q9JLL0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Crim1Q9JLL0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Crim1Q9JLL0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Crim1Q9JLL0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Crim1Q9JLL0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Crim1Q9JLL0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Crim1Q9JLL0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Crim1Q9JLL0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms