Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Col5a3Q9JLI2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Col5a3Q9JLI2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Col5a3Q9JLI2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col5a3Q9JLI2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col5a3Q9JLI2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col5a3Q9JLI2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Col5a3Q9JLI2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Col5a3Q9JLI2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Col5a3Q9JLI2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Col5a3Q9JLI2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Col5a3Q9JLI2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col5a3Q9JLI2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Col5a3Q9JLI2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Col5a3Q9JLI2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col5a3Q9JLI2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Col5a3Q9JLI2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col5a3Q9JLI2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Col5a3Q9JLI2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col5a3Q9JLI2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Col5a3Q9JLI2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Col5a3Q9JLI2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Col5a3Q9JLI2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Col5a3Q9JLI2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Col5a3Q9JLI2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col5a3Q9JLI2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Col5a3Q9JLI2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Col5a3Q9JLI2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Col5a3Q9JLI2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col5a3Q9JLI2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col5a3Q9JLI2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Col5a3Q9JLI2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Col5a3Q9JLI2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Col5a3Q9JLI2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Col5a3Q9JLI2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col5a3Q9JLI2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Col5a3Q9JLI2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Col5a3Q9JLI2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Col5a3Q9JLI2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Col5a3Q9JLI2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col5a3Q9JLI2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col5a3Q9JLI2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Col5a3Q9JLI2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col5a3Q9JLI2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col5a3Q9JLI2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col5a3Q9JLI2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col5a3Q9JLI2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Col5a3Q9JLI2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Col5a3Q9JLI2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col5a3Q9JLI2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Col5a3Q9JLI2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Col5a3Q9JLI2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Col5a3Q9JLI2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Col5a3Q9JLI2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Col5a3Q9JLI2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Col5a3Q9JLI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col5a3Q9JLI2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col5a3Q9JLI2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col5a3Q9JLI2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Col5a3Q9JLI2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col5a3Q9JLI2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Col5a3Q9JLI2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col5a3Q9JLI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Col5a3Q9JLI2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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