Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Herpud2Q9JJC9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Herpud2Q9JJC9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Herpud2Q9JJC9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Herpud2Q9JJC9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Herpud2Q9JJC9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Herpud2Q9JJC9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Herpud2Q9JJC9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Herpud2Q9JJC9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Herpud2Q9JJC9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Herpud2Q9JJC9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Herpud2Q9JJC9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Herpud2Q9JJC9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Herpud2Q9JJC9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Herpud2Q9JJC9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Herpud2Q9JJC9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Herpud2Q9JJC9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Herpud2Q9JJC9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Herpud2Q9JJC9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Herpud2Q9JJC9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Herpud2Q9JJC9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Herpud2Q9JJC9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Herpud2Q9JJC9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Herpud2Q9JJC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Herpud2Q9JJC9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Herpud2Q9JJC9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Herpud2Q9JJC9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Herpud2Q9JJC9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Herpud2Q9JJC9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Herpud2Q9JJC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Herpud2Q9JJC9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Herpud2Q9JJC9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Herpud2Q9JJC9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Herpud2Q9JJC9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Herpud2Q9JJC9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Herpud2Q9JJC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Herpud2Q9JJC9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Herpud2Q9JJC9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Herpud2Q9JJC9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Herpud2Q9JJC9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Herpud2Q9JJC9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Herpud2Q9JJC9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Herpud2Q9JJC9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Herpud2Q9JJC9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Herpud2Q9JJC9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Herpud2Q9JJC9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Herpud2Q9JJC9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Herpud2Q9JJC9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Herpud2Q9JJC9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Herpud2Q9JJC9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Herpud2Q9JJC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Herpud2Q9JJC9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Herpud2Q9JJC9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Herpud2Q9JJC9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Herpud2Q9JJC9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Herpud2Q9JJC9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Herpud2Q9JJC9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Herpud2Q9JJC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Herpud2Q9JJC9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Herpud2Q9JJC9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Herpud2Q9JJC9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Herpud2Q9JJC9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Herpud2Q9JJC9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Herpud2Q9JJC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Herpud2Q9JJC9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Herpud2Q9JJC9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Herpud2Q9JJC9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Herpud2Q9JJC9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Herpud2Q9JJC9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Herpud2Q9JJC9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Herpud2Q9JJC9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Herpud2Q9JJC9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Herpud2Q9JJC9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Herpud2Q9JJC9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Herpud2Q9JJC9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Herpud2Q9JJC9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Herpud2Q9JJC9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms