Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF7

Hpgds, Hematopoietic prostaglandin D synthase, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdsQ9JHF7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
HpgdsQ9JHF7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
HpgdsQ9JHF7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
HpgdsQ9JHF7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
HpgdsQ9JHF7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
HpgdsQ9JHF7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
HpgdsQ9JHF7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
HpgdsQ9JHF7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
HpgdsQ9JHF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
HpgdsQ9JHF7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
HpgdsQ9JHF7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
HpgdsQ9JHF7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,34■■□□□ 1,17
HpgdsQ9JHF7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,34■■□□□ 1,17
HpgdsQ9JHF7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
HpgdsQ9JHF7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,28■■□□□ 1,16
HpgdsQ9JHF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
HpgdsQ9JHF7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
HpgdsQ9JHF7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
HpgdsQ9JHF7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
HpgdsQ9JHF7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,18■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
HpgdsQ9JHF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
HpgdsQ9JHF7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
HpgdsQ9JHF7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,13■■□□□ 1,13
HpgdsQ9JHF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
HpgdsQ9JHF7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
HpgdsQ9JHF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,04■■□□□ 1,12
HpgdsQ9JHF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
HpgdsQ9JHF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,94■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21,93■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,93■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21,93■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,93■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,9■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
HpgdsQ9JHF7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21,89■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
HpgdsQ9JHF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
HpgdsQ9JHF7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
HpgdsQ9JHF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
HpgdsQ9JHF7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
HpgdsQ9JHF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
HpgdsQ9JHF7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,73■■□□□ 1,07
HpgdsQ9JHF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
HpgdsQ9JHF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
HpgdsQ9JHF7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
HpgdsQ9JHF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
HpgdsQ9JHF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
HpgdsQ9JHF7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
HpgdsQ9JHF7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
HpgdsQ9JHF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,64■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,62■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,6■■□□□ 1,05
HpgdsQ9JHF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,55■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
HpgdsQ9JHF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
HpgdsQ9JHF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
HpgdsQ9JHF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
HpgdsQ9JHF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
HpgdsQ9JHF7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21,45■■□□□ 1,02
HpgdsQ9JHF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
HpgdsQ9JHF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
HpgdsQ9JHF7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,42■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,2 ms